De Adviescommissie bestaat uit een vaste coördinatiegroep en een flexibele schil van deskundigen die per specifiek vraagstuk ah hoc mee kunnen denken. Dit kunnen leden zijn uit PGS-teams, maar ook deskundigen van buiten de Beheerorganisatie. Dit kunnen ook (betaalde) deskundigen zijn van onderzoeksbureaus, adviesbureaus en universiteiten. De Adviescommissie staat ten dienste van de Stuurgroep om gevraagd advies te leveren. Daarnaast adviseert de Adviescommissie de stuurgroep over de ontwikkelingen in het werkveld. Daarbij wordt een prioritering gemaakt in onderwerpen die volgens de Adviescommissie relevant zijn voor het werkprogramma. Een andere belangrijke taak is het opstellen van de Terms of Reference (ToR) voor een nieuw te ontwikkelen of te actualiseren PGS.